Nella tranquilla città di Mossingham, ai cui margini c'è la fattoria dove vive Shaun con le sue sorelle pecore, annunciano l'arrivo di un misterioso visitatore da una galassia molto lontana, è la piccola Lu-la schiantata con la sua navicella accanto alla fattoria di Mossy Bottom. Gli abitanti sono in piena alieno-mania, il fattore trasformerà la fattoria in un parco per gli alieni convinto di poterne trarre una fortuna e comprarsi un nuovo mietitrebbia.  Sarà Shaun ad aiutare Lu-la a ritornare a casa prima che una misteriosa agenzia governativa, con a capo la terribile Agente Red, la trovi.